Bioinformatique
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Les bases à clips souples sont-elles utilisées pour l'appel de variantes dans samtools + bcftools?
asked 2017-05-19 23:50:05 UTC
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Phyre2 vs ITasser, des modèles complètement différents générés
asked 2017-05-19 23:59:49 UTC
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En quoi les algorithmes à pic étroit et à pic large de MACS2 sont-ils différents?
asked 2017-05-20 05:21:09 UTC
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Étant donné un VCF d'un génome humain, comment évaluer la qualité par rapport aux SNV connus?
asked 2017-05-21 02:49:51 UTC
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Comment gérer l'hétérozygotie lors du polissage de l'assemblage du génome basé sur de longues lectures?
asked 2017-05-21 16:49:59 UTC
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Distribution attendue de la fréquence des allèles des SNV dans les données NGS réelles
asked 2017-05-22 15:47:44 UTC
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L'état, les limites et les comparaisons des grands magasins de variantes
asked 2017-05-22 21:14:17 UTC
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Conception d'un schéma de base de données de fichiers NGS de laboratoire
asked 2017-05-22 21:32:41 UTC
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Outils de simulation de lectures Oxford Nanopore
asked 2017-05-22 23:19:53 UTC
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Lettres majuscules ou minuscules dans le génome de référence
asked 2017-05-24 08:26:50 UTC
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Les effets d'une conversion incomplète du bisulfite sur l'efficacité de la cartographie
asked 2017-05-24 11:41:10 UTC
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Quels sont les avantages et les inconvénients de l'utilisation de KEGG ou de Reactome?
asked 2017-05-24 12:35:31 UTC
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Classification des échantillons en fonction de l'expression du gène marqueur
asked 2017-05-24 20:41:28 UTC
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Comment puis-je améliorer un assemblage à lecture longue avec un génome répétitif?
asked 2017-05-25 16:46:36 UTC
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Quelle est la différence entre les types de cellules ENCODE Tier 1, 2 et 3?
asked 2017-05-25 23:21:50 UTC
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variante appelant les données de style ChIP-seq: samtools mpileup avec des filtres minimaux
asked 2017-05-26 18:23:01 UTC
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Comment sélectionner les voies les plus représentatives à partir d'une analyse d'enrichissement génétique?
asked 2017-05-26 19:07:00 UTC
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Comment la contribution de la lignée cellulaire peut-elle être estimée à partir des données RNASeq?
asked 2017-05-30 12:30:54 UTC
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Quantification du mappage des lectures vers plusieurs locus
asked 2017-05-30 14:05:01 UTC
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Existe-t-il un ensemble de données multi-omiques accessible au public?
asked 2017-05-30 17:29:00 UTC
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Remappage des coordonnées génomiques pour tenir compte des indels
asked 2017-05-30 19:35:08 UTC
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Avoir des motifs ADN de 6 à 12 pb, en essayant d'obtenir des scores de conservation
asked 2017-05-31 02:18:08 UTC
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Est-il possible d'effectuer le séquençage MinION hors ligne?
asked 2017-05-31 11:22:09 UTC
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Comment puis-je améliorer le rendement des exécutions de séquençage MinION?
asked 2017-05-31 14:48:19 UTC
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Comment puis-je détecter systématiquement des séquences de codes-barres / adaptateurs inconnus dans un ensemble d'échantillons?
asked 2017-05-31 14:49:30 UTC
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Quels outils peuvent détecter l'ARN chimérique (gènes de fusion) à partir de données WGS ou RNA-Seq?
asked 2017-05-31 15:05:01 UTC
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Comment transférer des annotations GFF dans le génome avec des duplications étendues?
asked 2017-05-31 16:01:10 UTC
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Filtrage des SNP GWAS imputés sur la base d'une différence MAF de 10%
asked 2017-06-01 01:39:58 UTC
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Travailler avec d'anciennes versions de génome
asked 2017-06-01 01:47:18 UTC
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Y a-t-il un point dans le recalibrage des scores pour l'appel de variante?
asked 2017-06-01 03:33:00 UTC
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Téléchargement d'un génome de référence pour Bowtie2
asked 2017-06-01 03:56:27 UTC
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URL de téléchargement stables
asked 2017-06-01 04:40:03 UTC
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Variante structurelle nécessitant des données PacBio à faible couverture
asked 2017-06-01 04:46:41 UTC
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Imputation des génotypes manquants à partir de panels de génotypage séparés
asked 2017-06-01 12:27:26 UTC
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Existe-t-il des alternatives RepBase pour les annotations d'éléments répétés à l'échelle du génome?
asked 2017-06-01 16:11:10 UTC
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Quelle est la différence entre les versions 4.1 et 4.2 des spécifications VCF?
asked 2017-06-01 16:15:56 UTC
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Comment sélectionner des structures de haute qualité dans la banque de données sur les protéines?
asked 2017-06-01 18:04:41 UTC
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Estimation de la pureté de la tumeur / de la contamination / du mélange
asked 2017-06-01 18:08:20 UTC
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Utiliser des shells autres que bash
asked 2017-06-01 20:29:48 UTC
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Quel est le moyen le plus rapide de calculer le nombre de nucléotides inconnus dans les fichiers FASTA / FASTQ?
asked 2017-06-01 21:47:03 UTC
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Comment la «longueur effective» est-elle exactement calculée dans FPKM?
asked 2017-06-02 00:49:22 UTC
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Gènes manquants et normalisation de la sortie RSEM à l'aide d'EBSeq
asked 2017-06-02 03:57:13 UTC
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Recherche de l'emplacement et de la longueur unitaire des séquences répétitives dans une longue lecture
asked 2017-06-02 07:48:05 UTC
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Solveurs HMM génériques en bioinformatique?
asked 2017-06-02 12:13:13 UTC
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Existe-t-il des bases de données de modèles pour les formats de fichiers bioinformatiques courants?
asked 2017-06-02 19:08:50 UTC
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valider les sous-populations de cellules identifiées dans scRNA-seq
asked 2017-06-03 00:22:35 UTC
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Quels sont tous les fichiers de référence produits par bwa index et dépendent-ils du fait que la référence est compressée ou non?
asked 2017-06-03 00:36:08 UTC
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Pourquoi les fichiers BAM créés par différents outils ont-ils des tailles de fichier différentes?
asked 2017-06-03 04:38:14 UTC
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Comment puis-je sous-échantillonner un fichier BAM tout en conservant les deux lectures par paires?
asked 2017-06-03 04:44:45 UTC
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Quelle est la différence entre samtools, bamtools, picard, sambamba et biobambam?
asked 2017-06-03 04:50:11 UTC
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