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Format PDB: numéro de remarque pour le texte libre

asked 2017-06-23 20:59:36 UTC

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Quelle est la manière standard de travailler avec un génome de référence diploïde? Des brins complémentaires?

asked 2017-06-25 04:33:04 UTC

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Ordre de suppression des effets de lot, imputation des données et normalisation de la taille de la bibliothèque dans les données scRNA-seq

asked 2018-01-04 02:22:15 UTC

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Entrez or Ensembl gene IDs?

asked 2017-06-07 10:25:27 UTC

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Qu'est-ce que «k» dans le séquençage?

asked 2019-12-28 07:30:35 UTC

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Évaluer des groupes d'individus en utilisant leurs données de séquence

asked 2018-03-11 16:41:39 UTC

3

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Existe-t-il un moyen de récupérer plusieurs champs SAM plus rapidement que `samtools view | couper -f`?

asked 2017-08-23 01:51:08 UTC

1

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Filtrer les valeurs aberrantes du scRNA-seq (cellules hétérogènes)

asked 2017-12-18 04:11:39 UTC

1

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Calcul de la couverture: lectures longues (RNA-seq)

asked 2017-10-31 13:15:38 UTC

1

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Explication intuitive de l'analyse GSVA

asked 2018-03-11 02:33:00 UTC

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Comment générer un tanglegram à code couleur?

asked 2017-06-27 15:17:45 UTC

4

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Existe-t-il une API RESTful publique pour Gnomad?

asked 2017-06-28 17:54:00 UTC

2

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Assemblage du génome à partir de lectures sujettes aux erreurs

asked 2017-10-22 17:20:58 UTC

2

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Comment gérer l'hétérozygotie lors du polissage de l'assemblage du génome basé sur de longues lectures?

asked 2017-05-21 16:49:59 UTC

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Identifier les régions non codantes à partir d'une annotation du génome

asked 2019-02-22 18:20:35 UTC

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Remappage des coordonnées génomiques pour tenir compte des indels

asked 2017-05-30 19:35:08 UTC

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Quel est le nombre minimum d'individus par groupe requis pour l'analyse ADMIXTURE?

asked 2018-11-02 00:29:32 UTC

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appel de SNV diploïdes à partir de longues lectures

asked 2018-11-22 16:58:02 UTC

1

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Classification des échantillons en fonction de l'expression du gène marqueur

asked 2017-05-24 20:41:28 UTC

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CRISPR Sequence Finder et téléchargement de la base de données

asked 2017-12-12 04:52:12 UTC

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Comment écrire une fonction de hachage pour les kmers canoniques?

asked 2018-02-08 06:06:19 UTC

2

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Définition de "graine" dans l'alignement de séquence

asked 2019-03-16 08:22:52 UTC

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Analyse RIP-seq?

asked 2017-08-25 02:26:20 UTC

1

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Convertir les alignements locaux en alignements épissés dans le fichier SAM

asked 2017-08-30 18:24:42 UTC

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Convertisseur entre PDB ou mmCIF et MMTF

asked 2017-06-13 18:29:05 UTC

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réponses

Faire fondre les valeurs p pour la cartographie des sites CpG sur le même gène

asked 2017-08-10 21:25:38 UTC

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Dupliquer les gènes avec RSEM compte: lequel choisir?

asked 2017-11-30 16:09:02 UTC

3

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Existe-t-il un ensemble de données multi-omiques accessible au public?

asked 2017-05-30 17:29:00 UTC

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Rechercher des paralogues dans un projet de génome

asked 2018-07-05 15:29:30 UTC

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Conversion des noms de gènes d'un format de base de données publique à un autre

asked 2017-06-06 18:38:20 UTC

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Phyre2 vs ITasser, des modèles complètement différents générés

asked 2017-05-19 23:59:49 UTC

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Quels sont les services de cloud computing disponibles pour la bioinformatique?

asked 2017-06-12 16:51:35 UTC

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Améliorer un génome de référence avec des données de séquençage

asked 2017-05-18 08:11:37 UTC

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conception de complexe d'expression génique différentielle sans répliques

asked 2017-07-25 22:23:52 UTC

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Puisque chaque humain a un ADN différent (différentes combinaisons de C, G, A, T), que signifie faire le génome?

asked 2020-03-24 19:41:29 UTC

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réponses

Comment puis-je détecter systématiquement des séquences de codes-barres / adaptateurs inconnus dans un ensemble d'échantillons?

asked 2017-05-31 14:49:30 UTC

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Comparez la qualité d'alignement de plusieurs exécutions de séquençage alignées sur le même génome de référence

asked 2017-05-17 07:18:02 UTC

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Qu'est-ce que le «fragment de polymérase possible»?

asked 2018-06-10 06:23:30 UTC

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Pipeline PASA: comparez les transcriptions expérimentales à l'annotation de référence

asked 2017-07-03 14:09:33 UTC

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Le moyen le plus simple de déterminer le type de variante structurelle?

asked 2018-07-16 17:57:37 UTC

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ellipses de confiance pour le tracé MDS dans edgeR?

asked 2017-06-05 21:51:28 UTC

1

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Les lectures d'extrémité de paire avec une hétérozygosité élevée peuvent-elles être utilisées pour polir l'assemblage PacBio?

asked 2018-03-02 08:29:07 UTC

2

réponses

Comment obtenir tous les homologues PDB d'Uniprot (mapping + BLAST)?

asked 2017-12-12 19:33:06 UTC

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L'étincelle est-elle largement utilisée en bioinformatique?

asked 2017-06-04 04:10:33 UTC

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réponses

Inférer les fonctionnalités UTR manquantes dans le fichier GFF3

asked 2017-12-29 23:49:41 UTC

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réponses

Les exons peuvent-ils être situés en dehors de la séquence codante?

asked 2017-10-20 12:29:16 UTC

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Comment puis-je ancrer une protéine à un acide nucléique?

asked 2017-06-27 21:55:20 UTC

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Biais de 5 'et 3' dans les données Rna-seq

asked 2018-02-18 16:36:18 UTC

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Pourquoi mes résultats de kallisto et de saumon sont-ils si différents uniquement pour les transcriptions d'ARNnc?

asked 2019-04-23 21:20:36 UTC

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Outils pour créer un tableau annoté des variantes à partir de VCF

asked 2017-08-11 03:44:41 UTC